Malete - Primeros pasos

ATENCION: estas son unas notas informales tomadas en 2005, mientras aprendía a usar Malete. Aún falta transcribir una parte de ellas. Esto no está organizado como un HOWTO paso a paso para el recién llegado; es más bien una especie de bitácora donde registré los pasos que fui dando. Para generar un documento más útil habrá que reorganizarlo. ---Fernando

Vamos a intentar describir paso a paso un primer encuentro con Malete.

Setup

Malete puede descargarse desde http://malete.org/Doc/DownLoad, y la versión más reciente (en marzo de 2008) es la 1.0.3. Obtenemos el archivo malete.1.0.3.tgz, y lo descomprimimos:

tar xzf malete.1.0.3.tgz

Vemos que se crean cuatro directorios:

doc: aquí se encuentra la documentación; se trata de archivos de texto con una sintaxis al estilo wiki, a partir de los cuales se genera la versión HTML que está en el sitio web de Malete.

mlt: contiene el código fuente de Malete (archivos *.c y *.h), y el archivo Makefile.

php: aquí encontramos un par de demos y una biblioteca PHP que implementa funciones de lectura, escritura, consulta (query) e indización.

test: contiene dos bases de datos: cds (la tradicional base distribuida por Unesco), y unicode (una pequeña base para probar el uso de Unicode en Malete).

Cada una de las bases de datos dentro de test está compuesta por tres archivos:

<db_name>.m0d: malete options (record 0) file (collation y qué más?)

<db_name>.mqt: malete query terms

<db_name>.mrd: malete record data

Es importante notar que se trata de archivos de texto.

En el directorio principal está el archivo README, que contiene unas indicaciones para que podamos comenzar a interactuar con Malete:

make -C mlt server
then check out php/demo.php
or telnet localhost 2042
and type (be careful to use a tab after the Q with queries!):
test.Q
test.Q
test.Q	water
test.Q	plant water?
test.Q	plant + dev$
test.Q

Se trata solamente de una sugerencia inicial, como para comenzar a familiarizarnos con el protocolo de comunicación usado por Malete. Seguiremos esas indicaciones, y veremos qué sucede.

Compilación

Comenzamos entonces con el comando

make -C mlt server

Esto invoca al programa make, y le pasa dos argumentos: la opción -C mlt le indica que debe leer el Makefile del directorio mlt, y el target server ...?

Para que esto funcione, el sistema debe contar con las herramientas necesarias para llevar a cabo la compilación. Por ejemplo, en una instalación fresca de Ubuntu Dapper tuve que instalar dos paquetes: sudo apt-get install gcc sudo apt-get install build-essential

Una vez concluida la compilación, el mensaje final es

listening on '*:2042'

(El servidor Malete utiliza por defecto el puerto 2042.)

Como resultado de la ejecución de make, se han creado varios archivos. Hay un nuevo directorio bin, y de allí nos interesa especialmente el archivo malete, que es el ejecutable (279.052 bytes en la versión 1.0.3). Dentro del directorio test han aparecido estos 5 archivos:

test.m0d

test.mrd

test.mrx

test.mqd

test.mqx

Esta nueva base de datos, llamada test, es una copia de la base cds que vino con Malete. Más precisamente, los archivos test.m0d y test.mrd son copia de cds.m0d y cds.mrd, respectivamente, mientras que

test.mqd se genera a partir de cds.mqt

test.mrx se genera a partir de test.mrd

test.mqx se genera a partir de test.mqd y test.m0d

La base de pruebas

Podemos examinar la base cds con una herramienta conocida, el utilitario mx. Para ello, necesitamos crear una base Isis.

bin/malete cdsexp cds -ftest/
mx test/cds +control
mx test/cds pft=mfn,x3,v24.60/ now
...
000148 Personal statement
000149 For a training project based on programmed learning in the d
000150 Micropolitan development: theory and practice of greater-rur
fatal: recread/read

La primera sesión

Tenemos pues nuestro servidor Malete escuchando en el puerto 2042. Vamos a ver qué sucede al establecer una conexión vía telnet. Para esto abrimos otra consola, y en ella:

$ telnet localhost 2042
Trying 127.0.0.1...
Connected to localhost.
Escape character is '^]'.

El servidor Malete está listo para escuchar nuestros mensajes. Empecemos con test.Q, seguido por un doble Enter:

test.Q

Malete nos responde de esta manera:

# 151 0 0
-9 1@0
44 Methodology of plant eco-physiology: proceedings of the Montpellier Symposium
50 Incl. bibl.
69 Paper on: <plant physiology><plant transpiration><measurement and instruments>
24 Techniques for the measurement of transpiration of individual plants
26 aParis bUnesco c-1965
30 ap. 211-224 billus.
70 Magalhaes, A.C.
70 Franco, C.M.
-8 2@336
44 Methodology of plant eco-physiology: proceedings of the Montpellier Symposium
50 Incl. bibl.
69 Paper on: <plant evapotranspiration>
24 <The> Controlled climate in the plant chamber and its influence upon assimilation and transpiration
26 c1965
30 ap. 225-232 billus.
70 Bosian, G.

[Esos son los primeros 2 registros; siguen 18 más]

La línea inicial de la respuesta,

# 151 0 0

indica ...

A continuación aparece el primer registro de la base test:

-9 1@0
44 Methodology of plant eco-physiology: proceedings of the Montpellier Symposium
50 Incl. bibl.
69 Paper on: <plant physiology><plant transpiration><measurement and instruments>
24 Techniques for the measurement of transpiration of individual plants
26 aParis bUnesco c-1965
30 ap. 211-224 billus.
70 Magalhaes, A.C.
70 Franco, C.M.

Luego el segundo registro:

-8 2@336
44 Methodology of plant eco-physiology: proceedings of the Montpellier Symposium
50 Incl. bibl.
69 Paper on: <plant evapotranspiration>
24 <The> Controlled climate in the plant chamber and its influence upon assimilation and transpiration
26 c1965
30 ap. 225-232 billus.
70 Bosian, G.

y así sucesivamente, hasta llegar al número 20.

Al usar una consulta vacía, estamos recuperando todos los registros de la base (véase Protocol).

Cuando repetimos el mensaje test.Q (seguido, como en todos los casos, por doble Enter), obtenemos los siguientes 20 registros de la base test:

test.Q
# 131 0 0
-8 21@6320
24 <The> Determination of the evaporation from the plant cover and the surface of the soil by relating lysimeter and soil moisture measurements to potential evaporation
26 c1965
30 ap. 461-465 billus.
44 Methodology of plant eco-physiology: proceedings of the Montpellier Symposium
50 Incl. bibl.
69 Paper on: <evaporation><soil moisture><plant physiology><plant ecology><measurement and instruments>
70 Klausing, O.
-9 22@6741
44 Methodology of plant eco-physiology: proceedings of the Montpellier Symposium
50 Incl. bibl.
69 Paper on: <water balance><water yield><forests><plant ecology><rain><run-off><Israel>
24 Water yields of forest, Maquis and grass covers in semi-arid regions: a literature review
26 c1965
30 ap. 467-477 billus.
70 Shachori, A.Y.
70 Michaeli, A.

[siguen hasta el registro 40]

Pasemos ahora a una consulta no vacía: “test.Q water” (atención: luego de la Q hay un TAB):

test.Q	water
# 14 1 0
0 4
0 5
0 10
0 11
0 12
0 13
0 14
0 16
0 22
0 24
0 25
0 43
0 52
0 57

Lo que hemos hecho es una búsqueda por el término “water”, y lo que vemos es una lista de los 14 record-id encontrados (record-id es equivalente al MFN de cds/isis).

Pasemos a la siguiente consulta:

test.Q	plant water?
# 2 2 0
-9 5@1372
44 Methodology of plant eco-physiology: proceedings of the Montpellier Symposium
50 Incl. bibl.
69 <plant physiology><soil moisture><plant transpiration><evapotranspiration><measurement and instruments>
24 Anti-transpirants as a research tool for the study of the effects of water stress on plant behaviour
26 c1965
30 ap. 269-274 billus.
70 Gale, J.
70 Poljakoff-Mayber, A.
-8 25@7420
24 <The> Heat, water and carbon dioxide budget of plant cover: methods and measurements
26 c1965
30 ap. 495-512 billus.
44 Methodology of plant eco-physiology: proceedings of the Montpellier Symposium
50 Incl. bibl.
69 Paper on: <energy balance><water balance><carbon dioxide><plant physiology><heat transfer><measurement and instruments>
70 Baumgartner, Albert

Hemos realizado la consulta plant water?, y hemos recuperado los registros 5 y 25. Esta consulta consta de dos partes: una búsqueda (plant water) y un filtro (lo que aparece a la derecha del signo ?; en este caso, el filtro es vacío).

Obtuvimos los registros, y no solamente los identificadores. Véase Protocol.txt:

//If no filter is specified (i.e. no '?'), only record ids are returned.//

El uso del signo '?' hace que el servidor envíe los registros.

Siguiente consulta, de acuerdo con la sugerencia del archivo README:

test.Q plant + dev$
# 26 3 0
0 2
0 3
0 5
0 6
0 8
0 21
0 25
0 27
0 86
0 87
0 100
0 111
0 114
0 118
0 124
0 127
0 128
0 130
0 131
0 132

Como hay 26 registros y sólo recibimos los identificadores de los primeros 20, enviamos un nuevo mensaje “test.Q”:

test.Q
# 6 3 0
0 133
0 134
0 141
0 147
0 149
0 150

Si reiteramos el mensaje test.Q, ahora que ya hemos agotado los resultados para la última consulta, obtenemos:

test.Q
# 0 3 0

Repetimos la consulta plant water, esta vez sin el signo de interrogación final:

test.Q plant water
# 2 4 0
0 5
0 25

(en lugar de obtener los 2 registros, como antes, ahora sólo vemos la lista de identificadores).

Hemos estado usando un único tipo de mensaje: Q (query message, mensaje de consulta). La forma de este mensaje (para nuestra base test) es:

test.Q[*TAB*query]

donde query es una expresión en el lenguaje de consulta de Malete (véase Query).

La fila de números que encabeza la respuesta a un mensaje Q tiene el significado siguiente (véase Protocol):

número estimado de registros restantes, incluyendo los que acaban de ser leídos

número de la consulta, por el cual se la puede referenciar

truncation record id