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Malete - Primeros pasos
Vamos a intentar describir paso a paso un primer encuentro con Malete.
Setup
Malete puede descargarse desde http://malete.org/Doc/DownLoad, y la versión más reciente (en marzo de 2008) es la 1.0.3. Obtenemos el archivo malete.1.0.3.tgz, y lo descomprimimos:
tar xzf malete.1.0.3.tgz
SUGERENCIA: al descomprimir debería crearse un directorio 'malete-version'.
Vemos que se crean cuatro directorios:
doc: aquí se encuentra la documentación; se trata de archivos de texto con una sintaxis al estilo wiki, a partir de los cuales se genera la versión HTML que está en el sitio web de Malete.
mlt: contiene el código fuente de Malete (archivos*.cy*.h), y el archivoMakefile.
php: aquí encontramos un par de demos y una biblioteca PHP que implementa funciones de lectura, escritura, consulta (query) e indización.
test: contiene dos bases de datos:cds(la tradicional base distribuida por Unesco), yunicode(una pequeña base para probar el uso de Unicode en Malete).
Cada base de datos dentro del directorio test está compuesta por tres archivos:
<db_name>.m0d: malete options (record 0) file (collation y qué más?)<db_name>.mqt: malete query terms<db_name>.mrd: malete record data
Es importante notar que se trata de archivos de texto.
En el directorio principal está el archivo README, que contiene unas indicaciones para que podamos comenzar a interactuar con Malete:
make -C mlt server then check out php/demo.php or telnet localhost 2042 and type (be careful to use a tab after the Q with queries!): test.Q test.Q test.Q water test.Q plant water? test.Q plant + dev$ test.Q
Se trata solamente de una sugerencia inicial, como para comenzar a familiarizarnos con el protocolo de comunicación usado por Malete. Seguiremos esas indicaciones, y veremos qué sucede.
Compilación
Comenzamos entonces con el comando
make -C mlt server
Esto invoca al programa make, y le pasa dos argumentos: la opción -C mlt le indica que debe leer el Makefile del directorio mlt, y el target server …? TODO: ver los otros targets en el Makefile.
sudo apt-get install gcc sudo apt-get install build-essential
Una vez concluida la compilación, el mensaje final es
listening on '*:2042'
El servidor Malete utiliza por defecto el puerto 2042.
Como resultado de la ejecución de make, se han creado varios archivos. Hay un nuevo directorio bin, del cual nos interesa especialmente el archivo ejecutable malete (273 KB).
Dentro del directorio test fueron creados estos 5 archivos:
test.m0dtest.mrdtest.mrxtest.mqdtest.mqx
Esta nueva base de datos, llamada test, es una copia de la base cds que vino con Malete. Más precisamente, los archivos test.m0d y test.mrd son copia respectivamente de cds.m0d y cds.mrd, mientras que
test.mrxse genera a partir detest.mrdtest.mqdse genera a partir decds.mqttest.mqxse genera a partir detest.mqdytest.m0d
La base de pruebas
Podemos examinar la base cds con una herramienta conocida, el utilitario mx. Para ello, podemos crear una base Isis a partir de la base Malete. Previamente necesitamos recompilar malete para que trabaje con bases Isis en “formato Unix”, en lugar del “formato DOS” que usa por defecto:
$ export CDSUNIX=1 $ make -B -C mlt server # -B fuerza una recompilación
Ahora exportamos la base cds, de Malete a Isis:
$ bin/malete cdsexp cds -ftest/ $ mx test/cds +control *test/cds nxtmfn nxtmfb nxtmfp t reccnt mfcxx1 mfcxx2 mfcxx3 RC 152 122 320 0 150 0 0 0 0 ..
mx nos indica que hay 151 registros en la base, aunque el 151 no puede ser leído:
$ mx test/cds "pft=mfn,x2,v24(8,8)"/ from=148 now
000148 Personal statement
000149 For a training project based on programmed learning in the developing
countries: objectives, means and resources, organization and
management, development
000150 Micropolitan development: theory and practice of greater-rural
economic development
fatal: recread/read
También hay problemas para leer el diccionario usando mx:
$ mx test/cds water fatal: noderead/ock
$ mx dict=test/cds fatal: noderead/ock
Examinemos la versión DOS de la misma base (desde wine).
$ export CDSUNIX= # volvemos al default $ make -B -C mlt server
$ bin/malete cdsexp cds -ftest/
$ wine /media/win1/cisis/5.2/1030/mx test/cds +control
*test/cds
nxtmfn nxtmfb nxtmfp t reccnt mfcxx1 mfcxx2 mfcxx3 RC
152 122 12 0 150 0 0 0 0
..
$ wine /media/win1/cisis/5.2/1030/mx test/cds "pft=mfn,x2,v24(8,8)/" now from=148
000148 Personal statement
000149 For a training project based on programmed learning in the developing
countries: objectives, means and resources, organization and
management, development
000150 Micropolitan development: theory and practice of greater-rural
economic development
000151 Manuel pratique des assurances sociales
Notamos que en este caso mx nos muestra un registro 151, pero se trata de una copia (fantasma) del registro 101:
$ wine /media/win1/cisis/5.2/1030/mx test/cds from=101 mfn= 101 24 «Manuel pratique des assurances sociales» 26 «^aParis^bDOCIS^c1968» 30 «^a1 v. (loose-leaf)» 50 «Kept up-to-date» 69 «<social security><legislation><France><guides>» 71 «Documentation des institutions» ..x $ wine /media/win1/cisis/5.2/1030/mx test/cds from=151 mfn= 151 24 «Manuel pratique des assurances sociales» 26 «^aParis^bDOCIS^c1968» 30 «^a1 v. (loose-leaf)» 50 «Kept up-to-date» 69 «<social security><legislation><France><guides>» 71 «Documentation des institutions» ..x
El error en el diccionario es el mismo.
La primera sesión
Tenemos pues nuestro servidor Malete escuchando en el puerto 2042. Vamos a ver qué sucede al establecer una conexión vía telnet. Para esto abrimos otra consola, y en ella:
$ telnet localhost 2042 Trying 127.0.0.1... Connected to localhost. Escape character is '^]'.
El servidor Malete está listo para escuchar nuestros mensajes.
Consulta vacía
Empecemos con test.Q, seguido por un doble Enter:
test.Q
La Q indica que estamos haciendo una consulta (query), y la ausencia de parámetros hace que se trate de un caso especial de consulta, la consulta vacía. Con esta consulta recuperamos todos los registros de la base (véase Protocol).
Malete nos responde de esta manera:
# 151 0 0 -9 1@0 44 Methodology of plant eco-physiology: proceedings of the Montpellier Symposium 50 Incl. bibl. 69 Paper on: <plant physiology><plant transpiration><measurement and instruments> 24 Techniques for the measurement of transpiration of individual plants 26 aParis bUnesco c-1965 30 ap. 211-224 billus. 70 Magalhaes, A.C. 70 Franco, C.M. -8 2@336 44 Methodology of plant eco-physiology: proceedings of the Montpellier Symposium 50 Incl. bibl. 69 Paper on: <plant evapotranspiration> 24 <The> Controlled climate in the plant chamber and its influence upon assimilation and transpiration 26 c1965 30 ap. 225-232 billus. 70 Bosian, G. [Esos son los primeros 2 registros; siguen 18 más.]
La línea inicial de la respuesta,
# 151 0 0
es un comentario (lo sabemos pues comienza con '#'), que nos proporciona información acerca de la consulta realizada:
- '151' es la cantidad estimada de registros restantes para la presente consulta, incluyendo los recién leídos.
- '0' es el número de la consulta, que puede ser usado para referirse a ella desde futuras consultas; veremos que en sucesivas consultas este número va aumentando.
- record id de truncamiento: si no es '0', es el record id donde la búsqueda fue truncada debido al límite de tamaño para el conjunto de resultados.
A continuación aparece el primer registro de la base test:
-9 1@0 44 Methodology of plant eco-physiology: proceedings of the Montpellier Symposium 50 Incl. bibl. 69 Paper on: <plant physiology><plant transpiration><measurement and instruments> 24 Techniques for the measurement of transpiration of individual plants 26 aParis bUnesco c-1965 30 ap. 211-224 billus. 70 Magalhaes, A.C. 70 Franco, C.M.
Luego el segundo registro:
-8 2@336 44 Methodology of plant eco-physiology: proceedings of the Montpellier Symposium 50 Incl. bibl. 69 Paper on: <plant evapotranspiration> 24 <The> Controlled climate in the plant chamber and its influence upon assimilation and transpiration 26 c1965 30 ap. 225-232 billus. 70 Bosian, G.
y así sucesivamente, hasta llegar al número 20.
Vemos que cada registro se inicia con una línea que comienza con un número negativo de la forma -n, donde n es la cantidad de campos del registro. Debe notarse que esa línea inicial es también un campo.
Cuando repetimos el mensaje test.Q (seguido, como en todos los casos, por doble Enter), obtenemos los siguientes 20 registros de la base test, comenzando por el 21:
test.Q # 131 0 0 -8 21@6320 24 <The> Determination of the evaporation from the plant cover and the surface of the soil by relating lysimeter and soil moisture measurements to potential evaporation 26 c1965 30 ap. 461-465 billus. 44 Methodology of plant eco-physiology: proceedings of the Montpellier Symposium 50 Incl. bibl. 69 Paper on: <evaporation><soil moisture><plant physiology><plant ecology><measurement and instruments> 70 Klausing, O. -9 22@6741 44 Methodology of plant eco-physiology: proceedings of the Montpellier Symposium 50 Incl. bibl. 69 Paper on: <water balance><water yield><forests><plant ecology><rain><run-off><Israel> 24 Water yields of forest, Maquis and grass covers in semi-arid regions: a literature review 26 c1965 30 ap. 467-477 billus. 70 Shachori, A.Y. 70 Michaeli, A. [Siguen los registros hasta el 40.]
Vemos que la línea inicial de la respuesta, el comentario:
# 131 0 0
ahora nos indica que restan 131 registros (los primeros 20 ya los habíamos recibido), y el identificador de la consulta sigue siendo '0', pues seguimos solicitando resultados de la consulta anterior.
Consultas no vacías
Hagamos ahora una consulta no vacía, con el término water:
test.Q water # 14 1 0 0 4 0 5 0 10 0 11 0 12 0 13 0 14 0 16 0 22 0 24 0 25 0 43 0 52 0 57
Lo que hemos hecho es una búsqueda por el término “water”, y lo que vemos es una lista de los 14 record-id encontrados (record-id es equivalente al MFN de cds/isis). A diferencia del ejemplo previo, donde directamente recibíamos los registros completos, aquí solamente tenemos acceso a la lista de MFNs. Pero también podemos recuperar los registros:
test.Q water? # 14 2 0 -9 4@1043 44 Methodology of plant eco-physiology: proceedings of the Montpellier Symposium 50 Incl. bibl. 69 Paper on: <hygrometers><plant transpiration><moisture><water balance> 24 <An> Electric hygrometer apparatus for measuring water-vapour loss from plants in the field 26 c1965 30 ap. 247-257 billus. 70 Grieve, B.J. 70 Went, F.W. [... siguen 13 registros más.]
El signo de interrogación ? divide la consulta en dos partes: a la izquierda la expresión de búsqueda, a la derecha un filtro. En este caso el filtro es vacío, pero la sola presencia del signo ? hace que el servidor Malete nos envíe los registros.
If no filter is specified (i.e. no '?'), only record ids are returned.
La siguiente consulta, de acuerdo con la sugerencia del archivo README, es:
test.Q plant + dev$ # 26 3 0 0 2 0 3 0 5 0 6 0 8 0 21 0 25 0 27 0 86 0 87 0 100 0 111 0 114 0 118 0 124 0 127 0 128 0 130 0 131 0 132
De acuerdo con el comentario que encabeza la respuesta, hay 26 registros en el conjunto de resultados de nuestra consulta; como sólo recibimos los identificadores de los primeros 20 registros, enviamos un nuevo mensaje test.Q, sin indicar parámetros:
test.Q # 6 3 0 0 133 0 134 0 141 0 147 0 149 0 150
Tal como habíamos visto más arriba al usar una consulta vacía, el mensaje test.Q no crea una nueva consulta (de ahí que el número de identificación siga siendo '3'), sino que continúa solicitando más resultados para la consulta actual, si los hay.
Si reiteramos el mensaje test.Q, ahora que ya hemos agotado los resultados para la última consulta, obtenemos:
test.Q # 0 3 0
Repetimos la consulta plant water, esta vez sin el signo de interrogación final:
test.Q plant water # 2 4 0 0 5 0 25
(en lugar de obtener los 2 registros, como antes, ahora sólo vemos la lista de identificadores).
Hemos estado usando un único tipo de mensaje: Q (query message, mensaje de consulta). La forma de este mensaje (para nuestra base test) es:
test.Q[*TAB*query]
donde query es una expresión en el lenguaje de consulta de Malete (véase Query).
Lectura de registros
Además de recuperar registros a través de una consulta, podemos también solicitar al servidor Malete registros específicos en base a su id o MFN. Usamos para esto el mensaje R (read).
En este ejemplo, solicitamos el registro 4:
test.R*TAB*4 W -9 4@1043 44 Methodology of plant eco-physiology: proceedings of the Montpellier Symposium 50 Incl. bibl. 69 Paper on: <hygrometers><plant transpiration><moisture><water balance> 24 <An> Electric hygrometer apparatus for measuring water-vapour loss from plants in the field 26 c1965 30 ap. 247-257 billus. 70 Grieve, B.J. 70 Went, F.W.
Y en este otro ejemplo, solicitamos 2 registros comenzando por el 10:
test.R*TAB*10*TAB*2 W -12 10@2950 24 Modifications to the relative turgidity technique with notes on its significance as an index of the internal water status of leaves 25 20 25 30 25 40 26 c1965 30 ap. 331-342 billus. 70 Slatyer, R.O. 70 Barrs, H.D. 44 Methodology of plant eco-physiology: proceedings of the Montpellier Symposium 50 Incl. bibl. 69 <plant physiology><moisture><leaves> -9 11@3306 44 Methodology of plant eco-physiology: proceedings of the Montpellier Symposium 50 Incl. bibl. 69 Paper on: <plant physiology><water balance><pressure><hygrometers> 24 Measurement of water stress in plants 26 c1965 30 ap. 343-351 billus. 70 Kramer, P.J. 70 Brix, H.
También podemos leer una secuencia arbitraria de registros, donde los MFN no necesitan ser consecutivos. Por ejemplo, aquí leemos los registros 3, 7 y 9:
test.R 0*TAB*3 0*TAB*7 0*TAB*9 W -8 3@624 24 Control of conditions in the plant chamber: fully automatic regulation of wind velocity, temperature and relative humidity to conform to microclimatic field conditions 26 c1965 30 ap. 233-238 billus. 70 Bosian, G. 44 Methodology of plant eco-physiology: proceedings of the Montpellier Symposium 50 Incl. bibl. 69 Paper on: <plant physiology><moisture><temperature><wind><measurement and instruments><ecosystems> -9 7@2075 44 Methodology of plant eco-physiology: proceedings of the Montpellier Symposium 50 Incl. bibl. 69 Paper on: <plant physiology><carbon dioxide><chemical analysis><photosynthesis> 24 Colorimetric determination of CO2 exchange in field and laboratory 26 c1965 30 ap. 291-298 billus. 70 SlavÝk, B. 70 Catsky, J. -7 9@2687 44 Methodology of plant eco-physiology: proceedings of the Montpellier Symposium 50 Incl. bibl. 69 Paper on: <plant physiology><soil> 24 <A> New type of porometer for measuring stomatal opening and its use in irrigation studies 26 c1965 30 ap. 325-329 billus.
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