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Traza: • Henriette Avram • Tipos de registros, tipos de documentos, content vs. carrier, etc. • Utilitarios CISIS
utilitarios_cisis

Tabla de Contenidos

Utilitarios CISIS

Los utilitarios CISIS son un conjunto de aplicaciones (entre 25 y 30, según la versión y la plataforma), que permiten la manipulación a “bajo nivel” de bases de datos ISIS. Mediante estas herramientas, es posible realizar algunas de las tareas para las que se utiliza MicroIsis o Winisis (e.g., búsquedas, generación del archivo invertido, modificación de datos, exportación/importación de archivos ISO 2709), así como muchas otras que estos programas no contemplan.

El utilitario de uso más frecuente es mx, debido a su variada funcionalidad. También se usan habitualmente:

  • msrt, para ordenar archivos maestros,
  • i2id e id2i, para convertir bases ISIS en archivos de texto, y viceversa,
  • ifkeys, para obtener un listado de términos del diccionario.
  • crunchmf y crunchif, para convertir archivos maestros e invertidos, respectivamente, de una plataforma a otra (e.g., de Windows a Linux).
  • mxf0, para generar un informe sobre registros, campos y caracteres presentes en una base.

Estos utilitarios fueron desarrollados por Bireme, y su distribución es gratuita. El código fuente permanece cerrado.

Versiones

A julio de 2007, la última versión disponible es la 5.2, con las siguientes variantes:

  • Estándard (10/30). Maneja archivos maestros (.mst) con registros de hasta 32 Kbytes de tamaño — totalmente compatible con CDS/ISIS for Windows. Posee claves cortas de hasta 10 caracteres y claves largas de 11 a 30 caracteres.
  • Claves grandes (16/60). Idem a la versión estándard, excepto por los tamaños de las claves. La clave corta puede tener hasta 16 caracteres y la clave larga de 17 a 60 caracteres.
  • LIND (16/60). Idem a la versión de claves grandes, excepto por los recursos de búsqueda con restricción de campo, búsqueda por ocurrencia y por proximidad. Estos recursos fueron eliminados en favor del desempeño de la búsqueda y el tamaño del archivo invertido. Las extensiones de algunos archivos que componen el invertido fueron alteradas para permitir una fácil identificación.
  • FFI (16/60). Idem a la versión LIND, excepto por el archivo maestro que fue alterado en su estructura de control para permitir registros de hasta 1 Mbyte de tamaño, tornándose incompatible con el de CDS/ISIS en cualquiera de sus versiones hasta esta fecha.

!- A diciembre de 2004, la última versión disponible es la 4.3a, cuya versión para Linux está compuesta por los archivos siguientes: 

chkterm
crunchif
crunchmf
ctlmfn
fullinv.sh
i2id
id2i
ifkeys
ifload
ifmerge
ifp1
ifupd
loadiso.sh
lyfreq
mkiy0
mkxrf
msrt
mx
mxcp
mxf0
mxgw
mxmys
mx.pft
mxtb
mys
myz
myzcru
mz
retag
sizeof
wtrig1
wtrig2

-!

Información oficial, documentación y descarga de los utilitarios: Utilitarios CISIS en el catálogo de productos de la Biblioteca Virtual en Salud

!- Isis -!

crunchif

CISIS Interface v5.2b/PC32/M/32767/10/30/I - Utility CRUNCHIF
Copyright (c)BIREME/PAHO 2006. [http://www.bireme.br/products/cisis]

crunchif <dbn> <target_dbn> [<option> [...]]

options:

 -ifp                     -> don't crunch .ifp file
 /ifp                     -> crunch .ifp file if needed
 tell=<n>                 -> tell <n> records processed

 target={linux|hpux|sun|alpha|vax|unisys|mpe|cdc|pc}  default: linux

crunchmf

CISIS Interface v5.2b/PC32/M/32767/10/30/I - Utility CRUNCHMF
Copyright (c)BIREME/PAHO 2006. [http://www.bireme.br/products/cisis]

crunchmf <dbn> <target_dbn> [<option> [...]]

options:

 {from|to|loop|count|tell}=<n>

 target={pc|linux|hpux|sun|alpha|vax|unisys|mpe|cdc|same}  default: linux

 format={isis|cisisX}                                      default: isis

 mstxl={0|1|2|4}                                           default: as <dbn>

ctlmfn

CISIS Interface v5.2b/PC32/M/32767/10/30/I - Utility CTLMFN
Copyright (c)BIREME/PAHO 2006. [http://www.bireme.br/products/cisis]

ctlmfn <dbn>

i2id

CISIS Interface v5.2b/PC32/M/32767/10/30/I - Utility CTLMFN
Copyright (c)BIREME/PAHO 2006. [http://www.bireme.br/products/cisis]

ctlmfn <dbn>

id2i

CISIS Interface v5.2b/PC32/M/32767/10/30/I - Utility ID2I
Copyright (c)BIREME/PAHO 2006. [http://www.bireme.br/products/cisis]

id2i <filein> [create[/app]=]<dbout> [option [option] ... ]

options: {from/to/loop/count/offset/tell/id}=<n>


The logical record of <filin> has the format:

!ID mmmmmm
!vXXX!...contents of tag XXX.............
!vYYY!...contents of tag YYY.............
...

where mmmmmm is the MFN to be loaded

The contents of a tag may be split in 2 or more lines

ifkeys

CISIS Interface v5.2b/PC32/M/32767/10/30/I - Utility IFKEYS
Copyright (c)BIREME/PAHO 2006. [http://www.bireme.br/products/cisis]

ifkeys <dbname> [from=<key>] [to=<key>] [+tags]

 <dbname>   input inverted file
 from=<key> starting key
 to=<key>   ending key
 +tags      output tag information
 tell=<n>   produce a message every each <n> keys

 Displays the dictionary terms preceeded by the total number of postings

ifload

CISIS Interface v5.2b/PC32/M/32767/10/30/I - Utility IFLOAD
Copyright (c)BIREME/PAHO 2006. [http://www.bireme.br/products/cisis]

ifload <dbname> {<file_lk1>|void} {<file_lk2>|void} [<option> [...]]

 <dbname>               -> output inverted file
 <file_lk1>             -> sorted 10-byte link file
 <file_lk2>             -> sorted 30-byte link file

options:

 master=<name>          -> alternate master file
 -reset                 -> keep IF update is pending
 -posts                 -> do not load .ifp
 -balan                 -> do not rebalance the dict
 tell=<n>               -> tell <n> links has been loaded
 +fix[/m]               -> read fixed link records

ifmerge

CISIS Interface v5.2b/PC32/M/32767/10/30/I - Utility IFMERGE
Copyright (c)BIREME/PAHO 2006. [http://www.bireme.br/products/cisis]

ifmerge <out> <if1>[,n1] <if2>[,n2] [...] [<option> [...]]

 <out>                  -> output inverted file
 <if1>[,n1]             -> input inverted file #1, maxmfn#1
 <if2>[,n2]             -> input inverted file #2, maxmfn#2
  ...

options:

 +mstxrf                -> create <out> M/F and its mstxrf <out>.pft
 -posts                 -> do not load .ifp
 -balan                 -> do not rebalance the dict
 tell=<n>               -> tell <n> keys has been loaded

mx

CISIS Interface v5.2b/PC32/M/32767/10/30/I - Utility MX
Copyright (c)BIREME/PAHO 2006. [http://www.bireme.br/products/cisis]

mx [cipar=<file>] [{mfrl|load}=<n>] [cgi={mx|<v2000_fmt>}] [in=<file>]
   {[db=]<db>|
    seq[/1m]=<file>|
    iso[={marc|<n>}]=<isofile> [isotag1=<tag>]|
    dict=<if>[,<keytag>[,<posttag>[/<postsperrec>]]] [k{1|2}=<key>]}

options:
   from|to|loop|count|tell|btell=<n>
   text[/show]=<text>
   [bool=]{<bool_expr>|@<file>}  [invx=<tag101_mf>] [tmpx=<tmp_mf>]

   gizmo=<gizmo_mf>[,<taglist>]  [gizp[/h]=<out_mfx>] [decod=<mf>]

   join=<mf>[:<offset>][,<taglist>]=<mfn=_fmt>
   join=<db>[:<offset>][,<taglist>]=<upkey_fmt> [jmax=<n>]
   jchk=<if>[+<stwfile>]=<upkey_fmt>

   proc=[<proc_fmt>|@<file>]

         D{<tag>[/<occ>]|*}
         A<tag><delim><data><delim>
         H<tag> <length> <data>
         <TAG[ <stripmarklen>[ <minlen>]]><data></TAG>

         S[<tag>]
         R<mf>,<mfn>
         G<gizmo_mf>[,<taglist>]
         Gsplit[/clean]=<tag>[={<char>|words|letters|numbers|trigrams}]
         Gsplit=<tag>=6words[/if=<if>]
         Gload[/<tag>][/nonl][=<file>]
         Gmark[/<tag>]{/<elem>|/keys|/decs|/<mf>,<otag>[,<ctag>]}=<if>
         Gmarx[/<tag>]/<elem>[@<att>="x"] =<tag>[:&[<att>]|/c[=224]|/i]
         Gdump[/<tag>][/nonl][/xml][=<file>]
         =<mfn>
         X[append=]<mf>

   convert=ansi [uctab={<file>|ansi}]         [actab={<file>|ansi}]
   fst[/h]={<fst>|@[<file>]}                  [stw=@[<file>]]

   [mono|mast|full] {create|copy|append|merge|updatf}=<out_mf>
   [out]iso[={marc|<n>}]=<out_isofile>        [outisotag1=<tag>]
   fullinv[/dict][/m][/ansi]=<out_if> [-reset]
   ln{1|2}=<out_file>                         [+fix[/m]]
   fix=<out_file> tbin=<tag>
   tab[/lines:100000/width:100/tab:<tag>]=<tab_fmt>
   prolog|pft|epilog={<diplay_fmt>|@<file>}   [lw={<n>|0}]

   {+|-}control|leader|xref|dir|fields|all    [now] [mfrl]

msrt

CISIS Interface v5.2b/PC32/M/32767/10/30/I - Utility MSRT
Copyright (c)BIREME/PAHO 2006. [http://www.bireme.br/products/cisis]

msrt <dbname> <keylen> <keyfmt> [-mfn] [tell=<n>]

 <dbname> master file to be sorted in place or <dbn>,<0>
 <keylen> sort key length
 <keyfmt> format specification to generate sort keys or tag=<n>

 -mfn     keep the original MFNs
 +del     delete duplicate tag=<n> keys
 tell=<n> produce a message to the stderr every each <n> keys

mxcp

CISIS Interface v5.2b/PC32/M/32767/10/30/I - Utility MXCP
Copyright (c)BIREME/PAHO 2006. [http://www.bireme.br/products/cisis]

mxcp {in=<file>|<dbin>} [create=]<dbout> [<option> [...]]

options: {from|to|loop|count|tell|offset}=<n>
         gizmo=<dbgiz>[,tag_list>]
         undelete
         clean [mintag=1] [maxtag=9999]
         period=.[,<tag_list>]
         repeat=%[,<tag_list>]
         log=<filename>


 Ex: mxcp in create=out clean period=.,3 repeat=;,7

      in = 3 «   Field 3 occ 1. »
           3 «Field 3 occ 2 . »
           7 « Field 7/1;Field 7/2 ;Field 7/3.»

     out = 3 «Field 3 occ 1»
           3 «Field 3 occ 2»
           7 «Field 7/1»
           7 «Field 7/2»
           7 «Field 7/3.»

mxf0

CISIS Interface v5.2b/PC32/M/32767/10/30/I - Utility MXF0
Copyright (c)BIREME/PAHO 2006. [http://www.bireme.br/products/cisis]

mxf0 <dbname> [create=]<dbnout> [<tnrecs>] [noedit] [tell=<n>] [total]

 <dbname> input master file
 <dbnout> output master file for results
 <tnrecs> expected number of input records (default=0)

 noedit   suppress all leading spaces in the output data fields
 tell=<n> produce a message to the stderr every each <n> input records

 The following tags are output to <dbnout>:

  1001: input master file name
  1003: date & time stamp
  1009: total number of records
  1010: number of active records
  1011: number of logically deleted records
  1012: number of physically deleted records
  1013: next MFN to be assigned
  1020: ^tTAG ^dDOCS ^oOCCS ^lMINLEN ^uMAXLEN ^nDATA BYTES
  1030: ^tall ^xCHRCODE ^nCHRFREQ

 Exit code is 0 if the total number of records is equal to <tnrecs>

mxtb

CISIS Interface v5.2b/PC32/M/32767/10/30/I - Utility MXTB
Copyright (c)BIREME/PAHO 2006. [http://www.bireme.br/products/cisis]

mxtb <dbn> [create=|append=]<dbnout> <key> [<key> ...] [<option> [...]]

keys:    keylen:key_fmtspec

options: {from|to|loop|count|tell|btell}=<n>
         tab=<tab_val_fmt>
         mfnsum=<#levels> [{min|max}{avg|freq}=<n>]
         class=1000
         bool=<expr>
         uctab={<file>|ansi}

Ex: mxtb in out len1:fmt1 len2:fmt2 len3:fmt3

     out = 1  key/key1_value (max len1 chars)
           2  key/key2_value (max len2 chars)
           3  key/key3_value (max len3 chars)
         998  999999999 - key_frequency
         999  key_frequency

Ex: mxtb in out len:fmt tab=Vtag

     out = 1  key_value (max len chars)
         998  999999999 - Vtag_subtotal
         999  Vtag_subtotal

retag

CISIS Interface v5.2b/PC32/M/32767/10/30/I - Utility RETAG
Copyright (c)BIREME/PAHO 2006. [http://www.bireme.br/products/cisis]

retag <dbname> {<retag.tab>|unlock} [<option> [...]]

 <dbname>    master file to be retagged/unlocked
 <retag.tab> retag table

options:     {from|to|tell|shift}=<n>

The retag table is a sequential file in the format:

   <tag> <new tag>   (max 5461 entries)

The table:

 24 240
 70 700

changes tag 24 to 240 and 70 to 700

isis

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